本篇目录：

• 1、如何根据蛋白质得出其相应的基因名称?
• 2、简易批量生存分析工具!省时又省力!
• 3、如何将clusterProfiler富集结果中entrezID转化为基因名
• 4、请问用基因芯片得到很多差异基因的探针号和基因名称,怎样得到批量GO注释...

如何根据蛋白质得出其相应的基因名称?

1、(3)野生型基因和突变基因的 蛋白产物名称 与其各自的基因名相同，只是书写要用正体，如EXPA或expA1-1。

2、对纯化的蛋白进行测序，一般能测5个氨基酸以上，拿得到的氨基酸序列在NCBI上进行blast比对，有可能知道这是什么基因。得到的蛋白序列越长，知道是什么基因的可能性就越大。

3、(1) pcr法：将该蛋白质的氨基酸序列转译成相应的dna序列，根据此序列合成一对引物。

4、到这个网页 http：// 在靠近最上方的下拉箭头，点击，选中Gene。然后在右侧的空格处输入基因的名称（英文). 点回车就可以了。

5、打开NCBI主页。左边search里面选择GENE 右边的对话框里输入你想要的基因名称。 在出来的所有条目第一行后面都有种属表明，比如Homo sapiens是人Felis catus是猫。选择你想要的种属。

简易批量生存分析工具!省时又省力!

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3、药物组织分布用Drug And Statistics软件算。药物组织分布是指药物吸收后随血液循环到各组织间液和细胞内液的过程。

4、省时又省力：因为菠萝的长的纹路就是呈螺旋排列的，这样削比较省时又省力，非常的方便，同时浪费的又很少。

如何将clusterProfiler富集结果中entrezID转化为基因名

将Ensembl 中的蛋白ID转化成基因ID，可以通过clusterProfiler这个包。

注：1）MF和CC方法同BP，将BP改为MF，CC即可。2）可视化中，showCategory为显示的item数，scale_y_discrete则调节label过长的情况，让图片看起来 更美观。3)检查结果，可见geneID展示为gene symbol。

准备输入数据 待分析的数据就是一串基因名称了，可以是ensembl id、entrze id或者symbol id等类型都可以。把基因名称以一列的形式排开，放在一个文本文件中（例如命名“gene.txt”）。

请问用基因芯片得到很多差异基因的探针号和基因名称,怎样得到批量GO注释...

Converting GDS to an MAList ExpressionSet不包含注释信息， getGEO 可以帮助我们获取。与ExpressionSet不同，the limma MAList 包含基因注释信息。上面的gpl包含注释信息。

基因芯片的测序原理是杂交测序方法，即通过与一组已知序列的核酸探针杂交进行核酸序列测定的方法，在一块基片表面固定了序列已知的靶核苷酸的探针。

对差异表达基因进行功能预测 在基因芯片的数据分析中，研究者可以找出哪些差异表达基因属于一个共同的GO功能分支，并用统计学方法检验结果是否具有统计学意义，从而得出差异表达基因主要参与了哪些生物功能。

R分析差异表达基因的library有很多，但目前运用最广泛的Bioconductor包是limma。 鉴定差异表达基因是表达谱芯片分析pipeline中必须的分析步骤。差异表达基因分析是根据表型协变量(分类变量)鉴定组间差异表达，它属于监督性分类的一种。

到此，以上就是小编对于基因symbol转化为基因id的问题就介绍到这了，希望介绍的几点解答对大家有用，有任何问题和不懂的，欢迎各位老师在评论区讨论，给我留言。