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tair批量下载序列(如何批量下载序列)

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如何进行青花菜的基因表达与克隆?

在青花菜遗传资源及分子辅助育种中,主要涉及分子遗传图谱的构建、重要基因的标记与定位、基因的图位克隆、种质资源的研究、比较基因组研究及物种进化关系的研究等领域。

Hu等用4个10 bp 随机引物对14个青花菜和12个花椰菜品种进行了RAPD 检测,表明用其中2个引物足以区分14个青花菜品种,用3个引物可以区分12个花椰菜品种,说明RAPD 标记提供了一条快速可靠鉴别青花菜和花椰菜品种的方法。

tair批量下载序列(如何批量下载序列)-图1

Chen等(2001)利用催化细胞分裂素生物合成的异戊烯转移酶(ipt)基因转化到青花菜Geen King,经离体叶和小花的叶绿素含量检测表明,其较高的叶绿素保持量与ipt基因的表达相一致,说明导入ipt基因可延迟采后青花菜的黄化。

目前在甘蓝类蔬菜中的S位点已鉴定出50多个复等位基因。

怎样找到基因序列(请告诉详细步骤)O(∩_∩)O谢谢

打开拟南芥基因组网站(例如,https://)并进入“Gene Models”选项卡。 输入您要查找的基因名称,并选择“Gene Structure”选项卡。 找到基因的结构图,并单击打开。

tair批量下载序列(如何批量下载序列)-图2

在NCBI主页上方search栏左边有一个database选择框,点击下拉三角形选择nucleotide(如图红框)在search栏输入基因名搜索即可。

genebank,输入你要查找的基因名称,最好再输入种属缩小下范围,这样还是会出来一大堆摘要,仔细看一下描述,找到你需要的,点进去,里面有全基因的序列。

打开NCBI主页。左边search里面选择GENE 右边的对话框里输入你想要的基因名称。 在出来的所有条目第一行后面都有种属表明,比如Homo sapiens是人Felis catus是猫。选择你想要的种属。

tair批量下载序列(如何批量下载序列)-图3

基因在Genbank中的ID号,那就好办了,直接打开http:// ,在Search后的下拉框中选择Nucleotide,把Genbank ID号输入GO前面的文本框中,点“GO”,就可以找到了。

如何查找某一特定基因的序列以及它的SNP位点 关于这个问题,如果把序列下载下来然后一个个去找,不是一个好办法。

大侠,求问拟南芥数据库TAIR的使用方法

1、直接在主页右上角的搜索栏里输入要找的基因,找到后点击进入,往下翻翻页面就会看到一堆salk号,那些就是不同插入形式的突变体。

2、打开拟南芥基因组网站(例如,https://)并进入“Gene Models”选项卡。 输入您要查找的基因名称,并选择“Gene Structure”选项卡。 找到基因的结构图,并单击打开。

3、今天使用的是搜索框,最最顶端的搜索框,可以查找你需要的基因,以及salk号查询。之前的名字就是seed stock,后面改成了germplasm(种质资源)。通过这个入口,可以搜索相关Salk号的信息,这里随便写了一个salk号搜索一下。

4、首先拿到转录因子的基因ID,你既然说是29个我想你已经拿到这29个SBP基因的名字了吧。然后上 msu的Rice网站 以及 拟南芥的TAIR网站 的ftp下载全体蛋白的序列。

5、UniProtKB/TrEMBL还收录了所有EMBL-Bank/ GenBank/DDBJ核酸序列数据库中的编码序列的翻译后蛋白质序列和来自拟南芥信息资源库(TAIR)、SGD和人类Ensembl数据库中序列的翻译后蛋白质序列。

在tair网站怎么看一个基因的所有突变体序列

在tair网站怎么看一个基因的所有突变体序列 突变是生物的基本属性,在广义上,突变是指染色体数量、结构及组成等遗传物质发生多种变化,包括基因突变和染色体畸变。

这里可以看到该germplasm的T-DNA插入情况:单一插入还是多个位点插入;可能插入的位置(UTR, EXON OR INTRON);具体插入的染色体位置;此外还有一个查看全基因组序列的连接,可以进一步看到序列情况。

直接在主页右上角的搜索栏里输入要找的基因,找到后点击进入,往下翻翻页面就会看到一堆salk号,那些就是不同插入形式的突变体。

打开拟南芥基因组网站(例如,https://)并进入“Gene Models”选项卡。 输入您要查找的基因名称,并选择“Gene Structure”选项卡。 找到基因的结构图,并单击打开。

网站是:TheArabidopsisInformationResource,http://在TAIR主页,把鼠标放在工具栏“Tools”标签下,滑动鼠标至该标签弹出列表的“BulkDataRetrieval”处,点击该标签。

对这两个家系的先证者进行基因测序,家系1的致病突变为SPG3A基因c.1120CT(p.R239C),为已报道突变;家系2的致病突变为SPAST基因c.1196CA(p.S399X),为新突变。

...库中水稻基因组中29个SBP转录因子基因的序列下载下来,谢谢啊_百度...

首先拿到转录因子的基因ID,你既然说是29个我想你已经拿到这29个SBP基因的名字了吧。然后上 msu的Rice网站 以及 拟南芥的TAIR网站 的ftp下载全体蛋白的序列。

转录因子(英语:Transcription factor)是指能够结合在某基因上游特异核苷酸序列上的蛋白质,这些蛋白质能调控其基因的转录。方法是转录因子可以调控核糖核酸聚合酶(RNA聚合酶,或叫RNA合成酶)与DNA模板的结合。

转录因子一半都结合在被调控基因的promoter区域,你可以做一个chip-seq实验,然后在基因组数据库中定位这些与该转录因子结合的DNA区域,那么这些区域的下游附近的基因就很可能是受该转录因子调控的基因。

到此,以上就是小编对于如何批量下载序列的问题就介绍到这了,希望介绍的几点解答对大家有用,有任何问题和不懂的,欢迎各位老师在评论区讨论,给我留言。

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